Valuma-alueiden vesien korkeat fosfori- ja typpiarvot johtavat todistetusti rehevöitymiseen. Nykyinen direktiivi on edistänyt typpi- ja fosforipäästöjen vähentämistä, ja päivitetyssä direktiivissä tarkoituksena on tiukentaa tavoitteita entisestään. Fosforin poistaminen rautasuoloilla sekä kemiallisilla liuoksilla on menetelmänä kohtalaisen yksinkertainen ja helposti laajennettavissa, joka tekee tiukempien tavoitteiden noudattamisesta mahdollista. Typen poistaminen vedestä on prosessina hieman hankalampi bakteeriprosessiensa vuoksi. Se vaatii korkeampaa lämpötilaa, jolloin toteuttaminen on vaikeampaa alueilla, jossa veden keskilämpötila on 12 asteen alapuolella. Tämän takia olisi tärkeää, että puhdistamoille myönnetään poikkeus poistamistavoitteen saavuttamisesta niille päiville, jolloin veden lämpötila on alle 12 astetta.
Veden mikroepäpuhtaudet ovat yhteiskunnalle kasvava huoleen aihe. Tarkoituksena on esittää parlamentissa tiukempia sääntöjä ja korkeampia tavoitteita useampien mikroepäpuhtauksien osalta, jotta edetään kohti Euroopan vihreänsiirtymän ohjelman saasteettomuustavoitetta, jonka mukaan ympäristön tulisi olla vapaa haitallisista epäpuhtauksista vuoteen 2050 mennessä. Komissio on esittänyt saastuttaja maksaa- periaatteen (engl. polluter pays principle) käyttöönottoa vesialalle, ja tarkoituksena on tuoda myös parlamentin kantaan esitys laajennetusta tuottajavastuusta koskien markkinoille saatettuja lääkkeitä ja kosmeettisia valmisteita, sillä 92 prosenttia todetuista mikroepäpuhtauksista ovat peräisin lääkkeistä ja kosmetiikasta.
Lääkkeillä on kuitenkin tärkeä merkitys yhteiskunnan hyvinvoinnin ylläpitämiseksi tuoden myös yhteiskunnallista lisäarvoa. Yhteiskunnan tulisi kantaa vastuu näiden tuotteiden käytöstä, ja näin ollen myös vastata mikroepäpuhtauksien poistamisesta. Niinpä sekä laajennetun tuottajavastuun että mikroepäpuhtauksien poistamista varten tulisi perustaa rahoitusohjelma kansallisella tasolla, jonka olisi hallinnollisesti joustavampi tapa ratkaista tämä haaste.
Suomelle uuden direktiivin tavoitteet ovat saavutettavissa, sillä kolmannen vaiheen puhdistus ravinteiden poistamiseksi on nyt jo käytössä. Suurimmat taloudelliset haasteet tulevat olemaan niillä mailla, joilla ei vielä ole tätä vaihetta sisällytettynä puhdistusjärjestelmissään. Nämä ovat kuitenkin välttämättömiä toimenpiteitä jokaiselle jäsenmaalle saasteettomuustavoitteiden saavuttamiseksi.
